芒果MYB转录因子的鉴定及分析
作 者：
闫慧清;吴宗敏;周琴;孙贵连;黄绒
单 位：
贵州师范大学生命科学学院
关键词：
芒果（Mangifera indica L.）;转录组;MYB转录因子;
摘 要：
MYB是植物重要的转录因子,对果实的发育发挥重要的作用。本研究基于芒果果实和叶片转录组数据,运用Nr、Swiss-prot和Pfam数据库进行Unigene的功能注释,共鉴定得到125个MYB家族转录因子,其中包含4R-MYB （1）、R1R2R3-MYB （1）、R2R3-MYB （51）、R1-MYB （8）和atypical-MYB （64）。通过在线数据库分析表明具有R重复区的共61个MYB蛋白中大部分属于亲水性蛋白,且均不含有信号肽和跨膜结构,亚细胞定位于细胞核。序列比对和进化树分析表明:芒果MYB转录因子的结构域具有高度保守性,结构分析含有[W]-X （19）-[W]-X （19）-[W]结构。最后通过GO功能注释得到大部分的MYB具有结合和转录调节活性。除此之外,MYB还可以具有催化活性和转运活性。在生物过程中,主要以细胞过程、生物调节、生物调节过程、刺激响应和代谢过程居多。本研究为进一步挖掘和分析芒果MYB转录因子功能奠定了基础。
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