芒果八氢番茄红素脱氢酶(PDS)基因的克隆与表达分析
作 者:
俞凯莉;赵志常;高爱平;罗睿雄;黄建峰;张梦云;李茂富
单 位:
海南大学园艺学院;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点开发实验室国家热带果树品种改良中心
关键词:
芒果(Mangifera indica L.);八氢番茄红素脱氢酶;基因克隆;
摘 要:
八氢番茄红素脱氢酶(phytoene20desaturase,20PDS)影响类胡萝卜素的合成,是合成途径中关键基因。为了研究芒果果实中PDS基因的功能,本试验采用RACE方法从‘贵妃’芒果果实中克隆得到了一个八氢番茄红素脱氢酶(PDS),该基因全长c20DNA序列为12082020bp,开放阅读框为12065020bp,编码549个氨基酸,分子重量为61.3420kD,等电点为6.78。聚类分析发现芒果PDS蛋白与柚子、香瓜和番木瓜等植物的亲缘关系较近。其氨基酸组成主要是丙氨酸(ALa),白氨酸(Leu),缬氨酸(Val)等。利用定量PCR技术对不同品种中的PDS基因表达量分析,发现红色‘贵妃’品种表达量最高,而绿色‘桂七’品种表达量最低,对其蛋白的结构域、三级结构及互作蛋白进行了预测,发现其含有Phytoene-desat、PLNO248720superfamily等结构域。利用STRING数据库对其互作蛋白进行分析发现其与PSY、ZDS、CRTISO等蛋白可能有相互作用。本研究为进一步研究芒果果实类胡萝卜素生物合成的分子调控机理提供理论依据。
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