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当前位置: 首页 > 文章 > 龙眼微管蛋白家族成员全基因组鉴定及其在龙眼体胚发生早期的表达模式 福建农林大学学报(自然科学版) 2022,51 (3) 329-338
Position: Home > Articles > Genome-wide identification and expression pattern of tubulin gene family during the early somatic embryogenesis of longan Journal of Fujian Agriculture and Forestry University(Natural Science Edition) 2022,51 (3) 329-338

龙眼微管蛋白家族成员全基因组鉴定及其在龙眼体胚发生早期的表达模式

作  者：
路保顺;张舒婷;赵桦;张梓浩;赖钟雄;林玉玲
单  位：
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
关键词：
龙眼;tubulin;体细胞胚胎发生;表达模式
摘  要：
为研究微管蛋白(tubulin)家族成员在龙眼体胚发生早期的表达模式,基于龙眼基因组数据库,采用生物信息学方法对龙眼tubulin家族蛋白理化性质、系统进化关系、基因扩张、进化选择模式、染色体分布、基因结构、蛋白保守基序和启动子顺式作用元件进行分析.基于龙眼体胚发生早期转录组数据库,分析tubulin家族成员在体胚发生早期的表达模式,并采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术进行验证.结果表明:龙眼tubulin家族共有15个成员,其中,α-tubulin类型成员6个,β-tubulin类型成员8个,γ-tubulin类型成员1个(TUBG2),所有成员均包含tubulin和tubulin C两个保守结构域.同一类型tubulin家族成员间的亲缘关系较近,不同类型间的亲缘关系较远.龙眼tubulin家族15个成员分布在10条染色体上,氨基酸数目为197~473个,分子质量为21.88~53.25 ku,等电点为4.44~5.67,为酸性蛋白.龙眼tubulin家族基因外显子数目为3~11个,其编码的蛋白具有高度保守的基序.龙眼tubulin家族基因启动子区域存在光、激素、细胞周期、分生组织和抗逆境胁迫等响应元件.对tubulin家族基因在龙眼体胚发生早期的表达模式进行分析发现,龙眼tubulin家族大多数成员在体胚发生早期呈下调表达趋势,在胚性愈伤组织阶段的表达量高于球形胚阶段.以上结果表明,龙眼tubulin家族成员高度保守,且在胚性愈伤组织中大量累积,可能在龙眼胚性愈伤组织的胚性维持中发挥重要作用.
译  名：
Genome-wide identification and expression pattern of tubulin gene family during the early somatic embryogenesis of longan

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