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龙眼SNP高密度遗传图谱的构建及单果质量QTL定位

作  者:
张晨晨;王佳卉;刘丽琴;王一承;周建男;胡小文;石胜友
单  位:
华中农业大学园艺林学学院;中国热带农业科学院南亚热带作物研究所/农业部热带果树生物学重点实验室
关键词:
龙眼;高密度遗传图谱;高通量测序;QTL定位;连锁群;
摘  要:
以“凤梨朵”ד大乌圆”的杂交后代F1 200株(FD群体)作为作图群体,结合父母本,利用RAD-seq技术开发SNP标记,采用Joinmap 4.1软件构建遗传图谱,使用Mergemap进行整合;并采用MapQTL软件对单果质量进行QTL定位,确定QTL位点的数量、位置。结果表明,使用MergeMap软件对父母本连锁群进行整合,整合图谱共形成15个连锁群,总的遗传距离为2 873.39 cM,平均遗传距离为0.36 cM,包含8 014个SNP位点。在该图谱上监测到65个与单果质量性状相关的QTL位点,分布于lg1、lg3、lg4、lg5、lg8、lg10、lg14连锁群上。本研究所构建的遗传图谱是目前龙眼上所建立的标记数量最多,密度最高的遗传图谱,为未来龙眼数量性状精细定位、图位克隆以及功能基因挖掘等研究提供了有力的依据。

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