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铁皮石斛R2R3-MYB转录因子的全基因组鉴定及生物信息学分析

作  者:
李思芸;李婷婷;李霖;吴菁华
单  位:
福建农林大学园艺学院
关键词:
铁皮石斛;全基因组;MYB;生物信息学分析;
摘  要:
MYB是真核生物中一类重要的转录因子,广泛参与多种生物学过程。本研究利用生物信息学方法鉴定了铁皮石斛全基因组中MYB转录因子家族成员,共得到74个1R-MYB、136个2R(R2R3)-MYB和17个3R-MYB基因。136个R2R3-DoMYB的氨基酸序列大小介于89~980 aa,相对分子质量11.90~111.98 kD,理论等电位为4.9~10.21。亚细胞定位分析结果表明它们主要定位于细胞质中。R2R3-DoMYB基因包含1~14个外显子和0~13个内含子。系统进化分析表明,92个R2R3-DoMYB可以被分别归入26个亚组,其余44个R2R3-Do MYB未能进行明确归类。顺式作用元件预测结果显示该家族成员启动子包含光、激素以及响应生物与非生物胁迫的作用元件。研究结果为全面解析铁皮石斛MYB基因结构与生物学功能提供新信息,也为进一步研究它们在次生代谢产物中的调控功能奠定基础。

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