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河北北部地区PCV4流行株的遗传变异分析

作  者:
芮萍;王妍瑾;严世杰;宋涛;马增军;刘谢荣;张倩
单  位:
河北科技师范学院河北省预防兽医学重点实验室;河北省动物疫病预防控制中心
关键词:
猪圆环病毒4型;流行病学调查;遗传变异分析;
摘  要:
为了解河北省猪圆环病毒4型(PCV4)分子流行病学特点和遗传进化规律,本研究对2016年以来收集自河北北部地区395份临床猪血清、肺脏、脾脏等样品,采用PCR技术进行PCV4检测,并对9株PCV4的全基因组进行了扩增、克隆和测序,利用Megalign等软件分析其与参考株全基因组的遗传进化关系。结果显示,395份样品中,86份检测为PCV4阳性,阳性率21.8%,9株分离株与当前流行的PCV4参考株序列同源性高达98.1%~99.8%,与PCV1/2/3参考株相应序列同源性为42.0%~52.2%,与狐圆环病毒(Fox CV)、蝙蝠圆环病毒(Bat CV)和水貂圆环病毒(Mink CV)全基因组序列同源性分别为52.6%~52.9%,39.3%~39.5%和67.9%~68.7%。从遗传进化关系上,9株PCV4株与Mink CV属于同一分支,亲缘关系最近。本研究首次对河北北部地区进行了PCV4分子流行病学调查,证实河北地区存在PCV4流行,丰富了河北乃至我国PCV4的流行病学数据,为PCV4感染的防控提供了重要的参考价值。

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