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全基因组重测序解析不同牦牛类群的系谱及遗传结构

作  者:
王佟;马晓明;余道宁;马超凡;潘和平;梁春年;扎西塔;阎萍
单  位:
中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所;青海省海北州祁连县畜牧兽医工作站;西北民族大学生命科学与工程学院
关键词:
全基因组重测序;祁连牦牛;系谱;遗传资源;遗传结构
摘  要:
为了解不同牦牛类群的系谱及遗传结构,选择九龙牦牛、天祝白牦牛、斯布牦牛、帕米尔牦牛、木里牦牛、雪多牦牛、祁连牦牛和肃南牦牛为研究对象,进行全基因组重测序.根据基因型数据进行主成分分析、系统发育树、杂合度和连续纯合子片段分析等解析遗传结构.结果表明,8 个牦牛群体间均表现出较高的分化程度;8 个牦牛群体的理论杂合度在0.354 4~0.360 0 之间,其中肃南牦牛的观测杂合度最大,木里牦牛的观测杂合度最小;8 个牦牛群体的近交系数在0.022 9~0.136 0 之间;帕米尔牦牛群体中检测到的ROH(连续纯合子区域)数量最大,肃南牦牛最少.综上,8 个牦牛群体之间没有过多的基因交流,其中祁连牦牛是在长时间的进化发育过程中产生的一个单独的类群.
译  名:
Genealogy and Genetic Structure of Different Yak Taxa Analyzed by Whole Genome Resequencing
关键词:
whole genome resequencing%Qilian yak%genealogy%genetic resources%genetic structure

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