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牛CIS基因启动子区SNP及生物信息学研究

作  者:
杨永强;龚俞;焦仁刚;惠嫣婷;谢海强;刘若余
单  位:
贵州省畜牧技术推广站;贵州大学动物科学学院
关键词:
CIS;SNP;启动子;贵州荷斯坦奶牛;务川黑牛
摘  要:
为筛选CIS基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响.选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点.结果表明:CIS基因5′调控区3个SNPs位点,分别为G-726A、C-669T、C-82G;生物信息学软件预测得到CIS基因核心启动子区和CpG岛,SNP位点导致附近大量转录因子结合位点消失和新位点产生;多态性位点对转录因子结合位点、RNA二级结构稳定性均有显著影响,但并不改变CpG岛大小.

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