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类乌齐牦牛RNF216基因的克隆及组织表达分析

作  者:
陈美;柴志欣;武志娟;王会;王吉坤;王嘉博;钟金城;信金伟
单  位:
省部共建青稞和牦牛种质资源与遗传改良国家重点实验室; 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省教育部重点实验室
关键词:
类乌齐牦牛;RNF216基因;克隆;组织表达
摘  要:
[目的]为获得类乌齐牦牛环指蛋白216抗体(ring finger protein 216,RNF216)基因的CDS区序列,并研究RNF216基因在类乌齐牦牛不同组织中的表达情况.[方法]试验以0.5岁龄类乌齐牦牛为试验材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛RNF216基因CDS序列并进行生物信息学分析,利用荧光定量PCR(qPCR)方法检测RNF216基因在臀脂、臀肌、肝脏、肺脏、心脏和脾脏等组织器官中的表达情况.[结果]RNF216基因CDS区全长2610 bp,开放阅读框序列长2223 bp,共编码740个氨基酸.RNF216基因编码蛋白为不稳定亲水酸性蛋白,无信号肽和跨膜结构,主要分布在细胞核中.理化性质分析显示,牦牛RNF216蛋白存在24个丝氨酸、8个苏氨酸和9个酪氨酸磷酸化位点.一致性比较和进化树分析显示,牦牛与黄牛的遗传距离最近,与鼠类的遗传距离最远,且在进化过程中保守性强.组织表达分析显示,RNF216基因在类乌齐牦牛肺脏中的表达水平最高,其次是脾脏,然后是臀脂,在臀肌中的表达水平最低.[结论]本研究为进一步了解RNF216基因在调控牦牛肌肉生长发育方面提供参考数据.

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