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牦牛MEF2A基因克隆与差异性表达分析

作者：

邓磊;柴志欣;王会;王吉坤;信金伟;姬秋梅;钟金城

单位：

西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室

关键词：

类乌齐牦牛;MEF2A基因;克隆;组织表达;Real-time PCR

摘要：

MEF2A是一种由MEF2A基因编码的蛋白质,在心脏和平滑肌细胞的形态发生和肌细胞的生成过程中发挥关键作用.该研究运用RT-PCR技术并结合生物信息学分析方法,对西藏类乌齐牦牛MEF2A基因CDS区序列进行克隆及差异表达分析.结果表明:牦牛MEF2A基因CDS区全长1 469 bp,共编码489个氨基酸.分子式为C2263H3601N647O742S20,蛋白质分子量52 385.58,总原子数为7 273,理论等电点(pI)为6.27,消光系数为27515,不稳定指数60.68.脂溶系数和亲水性平均值分别是64.60、-0.604,该蛋白属于亲水性不稳定蛋白.蛋白质二级结构和三级结构预测结果显示, MEF2A蛋白主要由无规则卷曲、α螺旋和延长链在空间上折叠形成.牦牛MEF2A基因CDS区编码的氨基酸序列与普通牛、家猫、家犬、绵羊、小鼠、金钱豹、宽吻海豚、抹香鲸、美洲野牛、白犀、马、东北虎、猴的同源性分别为99.6%、96.1%、96.4%、99.6%、89.3%、96.8%、96.6%、96.8%、93.6%、97.2%、96.1%、96.3%、96.7%,该基因在不同物种高度保守.利用实时荧光定量PCR检测可知,MEF2A mRNA在牦牛臀肌、心脏、肝脏、肺脏中均有表达,且在臀肌中的表达优势较为显著(P<0.05).研究结果为进一步探讨MEF2A基因对牦牛肌肉代谢调控的分子机制研究提供了理论依据.

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