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当前位置: 首页 > 文章 > 中间锦鸡儿WRKY15基因克隆及其生物信息学分析 中国草地学报 2019,41 (4) 23-31
Position: Home > Articles > Cloning and Bioinformatics Analysis of CiWRKY15 Gene in Caragana in termedia Chinese Journal of Grassland 2019,41 (4) 23-31

中间锦鸡儿WRKY15基因克隆及其生物信息学分析

作  者：
张文静;李思;刘杨;王瑞刚;李国婧;万永青
单  位：
内蒙古农业大学生命科学学院;大连市食品检验所
关键词：
中间锦鸡儿;WRKY15;基因克隆;生物信息学
摘  要：
WRKY家族是高等植物中最大的转录因子家族之一,参与多种生物与非生物胁迫过程的调节.本研究采用PCR技术从中间锦鸡儿(Caragana intermedia)中克隆了CiWRKY15基因.结合生物信息学方法对Ci-WRKY15基因编码的蛋白质进行理化性质、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等进行预测分析.结果显示:Ci-WRKY15基因序列包含1005bp开放阅读框,编码335个氨基酸,含有一个典型的WRKY结构域,属于Group IId亚族.预测蛋白分子量为47.39KD,等电点为8.59,它的亚细胞定位于细胞核内.该研究结果为进一步挖掘与非生物胁迫相关的WRKY15转录因子的功能,以及为改进植物抗生物和非生物逆境的特性提供了理论依据.
译  名：
Cloning and Bioinformatics Analysis of CiWRKY15 Gene in Caragana in termedia
作  者：
ZHANG Wen-jing;LI Si;LIU Yang;WANG Rui-gang;LI Guo-jing;WAN Yong-qing;College of Life Sciences Inner Mongolia Agricultural University;Inner Mongolia Key Laboratory of Plant Stress Physiology and Molecular Biology;Inner Mongolia Scientific Innovation Team of Genetic Resource Utilization and Molecular improvement;Beijing Zhifei Lvzhu Biopharmaceutical Company Limited;Dalian Institute for Food Control;
关键词：
Caragana intermedia;;WRKY15;;Gene cloning;;Bioinformatics
摘  要：
In this study, WRKY15 gene was cloned from the cDNA of Caragana intermedia by PCR method. Bioinformatics analysis was used to predict the physico-chemical properties, subcellular localization, protein structure and phylogenetic evolution of the protein encoded by CiWRKY15 gene. The results showed that the CiWRKY15 gene sequence contained 1005 bp open reading frame, encoded 335 amino acids, and contained a typical WRKY domain, belonging to Group IId subgroup. The predicted molecular weight of putative protein was 47.39 KD and its isoelectric point was 8.59. Its subcellular localization was in the nucleus. The results of this study provide a theoretical basis for further exploring the function of WRKY15 transcription factors related to abiotic stress and improving the characteristics of plant resistance to biotic and abiotic stress.

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