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广西猫杯状病毒全基因组序列测定及其遗传进化分析

作  者:
丁仰保;何剑桥;刘林林;余良政;崔柏杨;周华波;韦祖樟;欧阳康;黄伟坚;陈樱
单  位:
家畜传染病与分子免疫学实验室;南宁市华波宠物医院
关键词:
猫杯状病毒;全基因组;ORF2基因;遗传进化分析
摘  要:
为了掌握广西猫杯状病毒(FCV)的流行情况及其变异规律.本研究于2018年3月至2019年9月采集疑似FCV鼻拭子59份,其中阳性检出率49.2%(29/59).将阳性病料接种CRFK细胞,成功分离获得一株FCV毒株,命名为NN01-19.为深入了解其遗传进化规律和分子特征,本研究通过RT-P C R方法扩增获得该毒株的全基因组序列,并对其ORF2基因进行了遗传进化和序列分析.结果表明,NN01-19毒株基因组全长7709 bp,其中ORF2基因全长2010 bp.遗传进化分析发现该毒株与广西早期分离株GX01-13同属基因I群,但核苷酸和氨基酸同源性仅为77.9%和86.5%.其中,超变区(E区)抗原线性表位新增T448A、T450G、G451Q和T454S四个突变位点.重要的是,该区域还发生了V430T的突变,符合VS-FCV致病性氨基酸突变特点.本研究为深入了解FCV的流行特点及其变异规律提供了参考依据,同时也为今后防控FCV提供了重要的理论基础.
译  名:
Sequencing of the Whole Genome and ORF2 Phylogenetic Analysis of A Feline Calicivirus Isolate from Guangxi

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