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延边牛UCP3基因CDS区克隆、生物信息学分析及组织mRNA表达研究

作  者:
孙斌;唐琳;张军芳;孙建富;崔岩;王英;王恩泽;李强;李香子
单  位:
延边大学农学院东北寒区肉牛科技创新教育部工程研究中心吉林省肉牛科学与产业技术重大需求协同创新中心
关键词:
延边牛;UCP3基因;克隆;生物信息学;组织mRNA表达;
摘  要:
本研究旨在对延边牛的UCP3基因进行克隆,分析其生物信息学特征,并探讨UCP3基因在延边牛不同组织的表达规律。选取3头20月龄延边牛,利用RT-PCR和基因克隆获得延边牛UCP3基因,与其他物种进行同源性比对及构建系统进化树,利用生物信息学方法预测UCP3编码蛋白质的理化性质、潜在的磷酸化位点等性质,利用RT-PCR方法检测UCP3基因在延边牛不同组织(心、肝、脾、肺、肾、小肠、脂肪和肌肉)的表达水平。结果显示:延边牛UCP3基因CDS区全长1 100 bp,编码311个氨基酸与黄牛同源性为100%,系统进化树表明延边牛与黄牛的亲缘关系最近;UCP3蛋白为不稳定蛋白,存在28个潜在的磷酸化位点;UCP3基因在延边牛脾脏中的表达量最高(P<0.05),而在肝脏与肾脏中的表达水平较低。

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