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鸭坦布苏病毒微滴式数字RT-PCR定量检测方法的建立与初步应用

作  者:
刘洋;李翔;原霖;张硕;王传彬;连红岩;张良一;顾小雪
单  位:
中国动物疫病预防控制中心;中国牧工商集团有限公司
关键词:
鸭坦布苏病毒;微滴数字RT-PCR;定量检测方法;
摘  要:
为建立一种特异性强、灵敏度高、重复性好的鸭坦布苏病毒(DTMUV)数字RT-PCR定量检测方法,采用鸭坦布苏病毒E基因为靶基因,在前期实时荧光定量RT-PCR方法的基础上,建立了可对其准确定量的微滴式数字RT-PCR方法。通过对反应体系中引物、探针浓度以及反应条件中反转录温度、时间、退火温度进行优化,确定最佳引物浓度为700 nmol/L,最佳探针浓度为350 nmol/L。该方法线性关系良好,在模板浓度为100~104拷贝/μL范围内其有良好的线性关系(R2=0.993 4);最低检测限为6.4拷贝/反应,比相同引物探针建立的实时荧光定量RT-PCR方法敏感一个数量级;同时,与其他禽源病毒无交叉反应,且重复性良好,对于103数量级的模板进行重复性检测,变异系数仅1.22%。通过对临床样品进行检测,结果显示该方法与实时荧光定量RT-PCR结果一致,表明该微滴式数字RT-PCR方法特异性强、敏感性高,可用于鸭坦布苏病毒的定量检测。

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