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Position: Home > Articles > Sequence Analysis on matK Gene from Pomegranate (Punica granatum) Germplasm Resources Molecular Plant Breeding 2020,18 (16) 5274-5279

石榴种质资源的matK基因序列分析

作  者:
马丽;周玉亮;郝兆祥;丁城实;侯乐峰;康美玲;罗华
单  位:
枣庄学院生命科学学院; 枣庄市石榴研究中心
关键词:
matK基因;石榴品种;遗传关系;DNA条形码
摘  要:
本研究以60个石榴品种为材料,PCR扩增获得石榴品种的matK基因片段,分析石榴资源的matK基因序列的碱基组成、序列间碱基变异频率和转换/颠换比率;计算品种间遗传距离(K-2P),构建遗传关系分类图,研究matK基因序列对石榴品种鉴定的效果.结果 表明,石榴物种的matK基因片段容易获得,PCR扩增成功率为98.3%,测序成功率为100%, 59个石榴品种matK基因片段最长为897 bp,最短为820 bp.石榴的matK序列保守性为95.8%,G+C含量相对稳定,平均含量为33.3%,A+T平均含量高达66.7%,密码子偏好A和T;序列碱基存在转换/颠换比率为1.003,核苷酸多样性为0.000 8,每位点核苷酸多态性指数Theta值为0.000 54.K-2P遗传距离在0.000~0.024之间,平均遗传距离为0.007,邻接法(NJ)构建59个品种遗传关系聚类图,59个品种被分为6大类,分类结果与形态学和品种地理来源分类没有明显相关性.
译  名:
Sequence Analysis on matK Gene from Pomegranate (Punica granatum) Germplasm Resources

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