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甜橙PEBP基因家族的鉴定及在成花过程的表达分析

作  者:
杨杰;贺新兴;陈蓉;胡乐贞;佟晓楠;李兴涛
单  位:
赣南师范大学生命科学学院
关键词:
甜橙;PEBP基因家族;生物信息学;进化关系;表达
摘  要:
磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine-binding protein,PEBP)基因家族的氨基酸结构中有保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白结构域,对控制植物花器发育和开花时间具有重要作用.本试验旨在研究CsPEBP基因家族对甜橙花期诱导的调控模式,利用PEBP蛋白特征结构域PBP的隐马尔可夫模型在甜橙基因组中进行HMMER分析,鉴定出7个CsPEBP基因,并对CsPEBPs编码蛋白的理化性质、蛋白基序、进化关系、顺式调控元件和表达谱等方面进行研究.结果表明CsPEBPs分布在甜橙5条染色体上.遗传进化树聚类成4个亚族,CsPEBP基因家族成员被分在TFL1-subclade、MFT-subclade、FT-subclade 3个亚族中.7个CsPEBP基因均含有光响应元件,表明CsPEBPs受光诱导调控.实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析发现,CsPEBP基因在两个甜橙品种花芽和叶片的表达模式不同,其中CsFT1和CsFT2在两甜橙品种花芽和叶片中的相对表达量均有显著上调的趋势,而CsTFL1a、CsTFL1b和CsTFL1c在它们花芽和叶片中的相对表达量均显著下调;另外,早熟品种'赣南早'开花时期,'赣南早'花芽和叶片中CsFT亚族基因的表达量高于对照品种'纽荷尔',而CsTFL1亚族基因是相反的,说明花芽细胞内CsFTs高表达和CsTFL1s低表达导致了甜橙花期提前,CsPEBPs对调控甜橙开花时间起重要作用.本研究获取了甜橙PEBP基因家族成员的序列和部分功能信息,为进一步分析CsPEBP基因家族在甜橙成花转变中的功能提供参考.
译  名:
Genome-wide Identification of PEBP Gene Family and Expression Analysis during Flowering Process in Citrus sinensis

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