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短小芽孢杆菌非编码RNA Bpsr145的鉴定及初步探究

作  者:
宋婷;徐云帆;贺婷停;覃佳;黄宇;王海燕
单  位:
四川大学生命科学学院/生物资源与生态环境教育部重点实验室
关键词:
短小芽孢杆菌;小非编码RNA;Northern blotting;基因敲除;
摘  要:
【目的】基于前期对短小芽孢杆菌SCU11的转录组测序结果,对在转录组数据中不同阶段的表达量存在较明显差异的候选sRNA Bpsr145进行鉴定及探究。【方法】通过Northern blotting和独立转录验证Bpsr145的表达,使用不同的程序对其序列保守性、二级结构以及靶标基因进行分析,另外利用电转化方法构建一个Bpsr145敲除突变体。【结果】证实Bpsr145是一个真实存在并独立转录的sRNA,且在不同的培养基中显示不同的表达谱,但Bpsr145敲除菌株和野生型菌株在生长情况和蛋白质谱中不存在显著差异。【结论】本研究鉴定了一个短小芽孢杆菌的sRNA,丰富了芽孢杆菌非编码RNA数据库,为研究非编码RNA介导的转录后调控提供了新的材料。

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