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梨火疫病菌新的Ⅲ型泌出系统(T3SS)分析及在其他菌株中的分布

作者：

柴一秋;BOCSANCZY Ana Maria;BEER Steven;王金生

单位：

康奈尔大学植物病理系;南京农业大学植物保护学院/农业部病虫监测与治理重点开放实验室

关键词：

梨火疫病菌;新的T3SS致病岛;PCR;Southern blot

摘要：

试验分析了梨火疫病菌(Erwinia amylovora)Ea273基因组上新的T3SS(TypeⅢSecretion System,T3SS)致病岛特征并验证它们在Erwinia属的21个菌株基因组上是否存在。生物信息学分析发现,Ea273基因组不同位点上存在两个新的T3SS致病岛,称为PAI-2和PAI-3,大小分别为32.889kb和21.792kb。经PCR和Southern blot证明Ea273、Ea246、Ea262、Ea528以及Ea6445个菌株基因组存在PAI-2和PAI-3。PAI-3和PAI-2在基因结构和组成上相似,同源性超过70%,PAI-3包含PAI-2所有基因,两者和昆虫内生菌S.glossinidius编码的T3SS的SSR-1致病岛非常相似。

译名：

Bioinformatics Analysis on a Novel T3SS Pathogenicity Islands of Erwinia amylovora Ea273 and its Homology in Erwinia

作者：

CHAI Yi-qiu1,2,BOCSANCZY Ana Maria3,BEER Steven3,WANG Jin-sheng1 (1.Key Laboratory of Monitoring and Management of Plant Disease and Insect, Ministry of Agriculture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China; 2.The Subtropical Crops Institute of Zhejiang, Wenzhou 325005, Zhejiang, China; 3. Department of Plant Pathology, Cornell University, Ithaca 14853,NY,USA)

关键词：

Erwinia amylovora; novel T3SS pathogenicity islands; PCR; Southern blot

摘要：

The novel T3SS (Type Ⅲ Secretion System, T3SS) pathogenicity islands were analyzed in the genomic sequence of Ea273, and their existences were verified in the genomic sequences of other 21 strains of Erwinia. In different site, two novel PAIs named PAI-2(32.889kb) and PAI-3(21.792kb) which coded T3SS were found by analyzing genomic sequence of E. amylovora Ea273. The results of PCR and Southern blotting of 21 Erwinia strains indicated that PAI-2 and PAI-3 existed in the genomic DNA of five strains which included strain Ea273 of E. amylovora pv. amylovora, Ea246 of E. amylovora pv. rubicola, Ea262 and Ea528 of E. rubicida, as well as Ea644 of E. pyrifoliae. The similar structure, composition and 70% comparability between PAI-3 and PAI-2 were observed. The gene of PAI-2 was involved in PAI-3 and both of them were similar to the SSR-1 of endosymbiont of tsetse flies (S. glossinidius).

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