中国农业期刊集成服务平台

当前位置: 首页 > 文章 > 马铃薯A病毒云南分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析西南农业学报 2006,19 (6) 1078-1081

Position: Home > Articles > Cloning and sequencing of the coat protein gene of Potato virus A from Yunnan Southwest China Journal of Agricultural Sciences 2006,19 (6) 1078-1081

马铃薯A病毒云南分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析

作者：

丁铭;方琦;张丽珍;李婷婷;董家红;张仲凯

单位：

云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所

关键词：

马铃薯A病毒;云南分离物;外壳蛋白基因;序列分析

摘要：

根据马铃薯病毒A(Potato virusA,PVA)外壳蛋白(CP)基因序列设计合成的一对引物,以带病毒植株总RNA为模板,RT-PCR扩增得到长约800 bp的目的片段。将目的片段克隆至pGEM-T Easy载体并进行了序列测定,测得全长为807 bp的PVA CP基因。测序结果与PVA其他分离物CP基因序列比较,其氨基酸同源性最高可达98.5%。根据GenBank中PVA CP氨基酸序列建立了病毒的系统进化树并对PVA不同分离物CP氨基酸序列差异性进行了分析。

译名：

Cloning and sequencing of the coat protein gene of Potato virus A from Yunnan

作者：

DING Ming,FANG Qi,ZHANG Li-zhen,LI Ting-ting,DONG Jia-hong,ZHANG Zhong-kai~*(Biotechnology and Genetic Resources Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences,Yunnan Kunming 650223,China)

关键词：

PVA;Yunnan isolate;coat protein gene;sequence analysis

摘要：

Using specific primers which were designed based on Potato virus A(PVA) coat protein (CP) gene sequences,a DNA fragment(800bp) was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR) using the total RNA extracted from the potato plant showed mosaic symptom.The fragment was cloned into pGEM-T Easy vector and then sequenced.Sequence comparison showed it had high sequence homology with CP gene of other PVA isolates with 98.7% at nucleic acid level and 98.5 % at amino acid level.Phylogenetic tree based on CP amino acid sequences of PVA was established and the relationship among the isolates was compared.

相似文章

马铃薯A病毒CP基因的克隆与序列分析 [吴兴泉, 陈士华, 吴祖建, 林奇英, 谢联辉] 植物保护 2003,29 (5) 25-28
马铃薯A病毒及其风险分析 [张洪峰, 陈阳婷, 孟兴, 谭家兴, 张敏, 宁红] 植物检疫 2010,24 (4) 48-51
双引物探针RT-Realtime PCR检测马铃薯A病毒 [张京宣, 梁炜, 耿金培, 陈洪俊, 杨益娥, 粟智平] 植物检疫 2012,26 (1) 26-28
云南马铃薯A病毒分布及其外壳蛋白分子变异分析 [王东, 张磊, 董家红, 张仲凯] 西南农业学报 2012,25 (2) 525-530
马铃薯A病毒重组CP多克隆抗体的制备及其在DAS-ELISA检测中的应用 [宋志成, 费新敏, 杨煜, 乔利仙, 王晶珊, 李广存, 郭宝太] 华北农学报 2017,32 (1) 41-46
杭州郊区马铃薯A病毒分离物的基因组3’-末端序列测定及系统进化分析 [程晔, 陈炯, 陈剑平] 浙江农业学报 2002,14 (2)
应用RT-POR技术检测马铃薯A病毒 [耿宏伟, 白艳菊, 范国权, 高艳玲, 张威, 申宇, 马纪, 郭怡?] 中国马铃薯 2009,023 (6) 329-332
马铃薯A病毒复制相关蛋白研究进展 [吴兴泉, 谭晓荣, 陈士华] 中国马铃薯 2006,20 (4) 231-234
应用RT-PCR技术检测马铃薯A病毒 [耿宏伟, 白艳菊, 范国权, 高艳玲, 张威, 申宇, 马纪, 郭怡璠] 中国马铃薯 2009,23 (6) 329-332
马铃薯A病毒RT-LAMP检测方法的建立 [刘洪义, 辛言言, 刘忠梅, 杨长志, 杨立群, 张永江] 中国农学通报 2015,31 (11) 143-147

导出引用

计量

文章访问数: 8

HTML全文浏览量: 0

PDF下载量: 0

马铃薯A病毒云南分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析

相似文章

所属期刊

西南农业学报

推荐期刊

植物检疫

中国马铃薯