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大恒799肉鸡Myoz1基因CDs区克隆、序列分析及其组织表达研究

作  者:
朱师良;余春林;邱莫寒;张增荣;熊霞;胡陈明;杨礼;彭涵;陈家磊;宋小燕;夏波;刘思洋;蒋小松;杜华锐;李晴云;杨朝武
单  位:
四川省畜牧科学研究院动物遗传育种重点实验室
关键词:
大恒肉鸡;Myoz1基因;克隆;生物信息学分析;组织表达
摘  要:
为研究钙调神经磷酸酶肌小结结合蛋白1(Myoz1)的氨基酸序列特征及其在不同组织器官中的mRNA表达水平,试验通过PCR克隆Myoz1 CDs序列,分别利用ExPASYProtparam、ProtScale、Target P、DNAStar Protean、SWISS-MODEL、SignalP 4.1 Server、NetPhos2.0Server和STRTNG软件,进行Myoz1蛋白理化特性、亲/疏水性、亚细胞结构、蛋白二级结构、三级结构、信号肽、磷酸化位点和蛋白互作分析,并通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测Myoz1基因表达量。结果显示:大恒799肉鸡Myoz1基因CDs序列全长为881 bp,可编码293个氨基酸;大恒799肉鸡Myoz1基因氨基酸序列与雉鸡、岩雷鸟位于一个分支,同源性最高,均高于96%,亲缘关系最近;Myoz1蛋白为水溶性蛋白且大多分布于细胞核内,分子式为C1442H2244N400O430S10,分子质量约为32 384.70 ku,理论等电点为9.12;Myoz1蛋白不存在信号肽,为分泌蛋白,共存在37个潜在的磷酸化位点、1个N-糖基化潜在位点;Myoz1蛋白二级结构主要由α-螺旋、β-转角和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与其一致;Myoz1蛋白与ACTN2、LDB3、LMOD3等Z盘蛋白(PDZ-LIM结构域蛋白,ZASP)以及肌肉生长发育相关蛋白有相互作用的关系;Myoz1在1日龄大恒799肉鸡胸肌和腿肌的表达量显著高于其他组织,且在胸肌中的表达量高于腿肌(P<0.05)。研究表明Myoz1基因可能在肌肉生长发育过程中发挥调控作用。

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