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Position: Home > Articles > Screening and Bioinformatics Analysis of Almond MADS-box Gene Family Molecular Plant Breeding 2022,20 (5) 1477-1486

扁桃MADS-box基因家族的筛选与生物信息学分析

作  者:
刘兴跃;何仲坚;邱毅敏
单  位:
广州市林业和园林科学研究院
关键词:
扁桃;MADS-box基因家族;生物信息学;系统进化树
摘  要:
MADS-box蛋白作为一种重要的转录因子,调控扁桃生殖和营养生长,分析鉴定扁桃MADS-box基因家族,可以为探究扁桃生物学功能提供铺垫.基于扁桃基因组数据,通过HMMER3.0软件分析扁桃的 MADS-box基因TypeⅠ型及MIKC型,使用MEGA 7.0、MEME完成染色体定位、基因结构和Motif预测分析.在全基因组水平本研究一共鉴定出65个扁桃MADS-box基因,染色体定位发现这些基因分布在八条染色体上,motif结果显示所有MADS-box蛋白中都有MADS结构域的存在,基因结构分析发现,外显子、内含子结构和长度在亚组表现一致.本研究利用生物信息学分析手段,鉴定了扁桃MADS-box基因家族,获得扁桃开花和生长发育的相关基因,对发现扁桃开花器官的生长发育等一系列的重要性状和分子育种提供了重要的理论与应用价值.
译  名:
Screening and Bioinformatics Analysis of Almond MADS-box Gene Family

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