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兴安落叶松叶光合与氮代谢对环境变化响应的转录组分析

作  者:
刘梅朔;王传宽;全先奎
单  位:
东北林业大学生态研究中心
关键词:
气候变化;光合作用;响应机理;生态型;基因表达
摘  要:
为了揭示兴安落叶松针叶光合作用对环境变化响应的分子机制,采用高通量测序技术,对生长环境差异明显的4个样地[塔河(52°52′ N)、松岭(50°72′N)、黑河(49°22′N)和带岭(47°08′N)]兴安落叶松针叶进行转录组测序,并比对不同样地树木针叶的差异表达基因(DEGs).结果表明:共获得高质量短读序282428811条,其中在塔河-松岭、塔河-黑河、塔河-带岭、松岭-黑河、松岭-带岭、黑河-带岭6个对比组中,分别筛选出16915、18812、28536、20635、29957和23617条差异表达基因.在KEGG代谢通路分析中,光合作用通路中编码光系统Ⅱ(PSⅡ)的Psb基因家族的9个基因(即PsbB、PsbK、PsbO、PsbP、PsbQ、PsbS、PsbW、Psb27 和 Psb28)及编码 F 型 ATP 酶的 3 个基因(即 ATPF1A,atpA、ATPF1G,atpG 和 ATPF1D,atpH)均随样地间的环境差异增大而呈现明显上调;氮代谢通路中编码谷氨酰胺合成酶的基因(glnA,GLUL)、硝酸还原酶的基因(NR)、碳酸酐酶的基因(cynT,can)也呈现同样的上调.DEGs和上调基因的数量均随样地环境变化增大而增多,进而导致了兴安落叶松针叶光合能力在样地间的差异.
译  名:
Transcriptome analysis on responses of leaf photosynthesis and nitrogen metabolism of Larix gmelinii to environmental change

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