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PID1基因在白洗猪不同组织器官中的表达研究及生物信息学分析

作  者:
苑洪霞;冯文武;孙振梅;陈祥
单  位:
贵州省种畜禽种质测定中心;贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室/贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室/贵州大学动物科学学院;贵州省生猪健康养殖工程技术研究中心
关键词:
白洗猪;PID1;荧光定量PCR;二级结构;结构域
摘  要:
为了探究PID1基因在白洗猪各组织器官中的表达水平及其结构和功能特性,为PID1基因对猪脂肪沉积的作用及其蛋白质特性研究提供理论基础,试验以白洗猪为研究对象,运用实时荧光定量PCR和Nest PCR法分析PID1基因mRNA在白洗猪9个不同组织器官中的表达水平,运用T克隆、蓝白斑筛选等技术克隆PID1基因的CDS区,进一步运用生物信息学软件分析PID1蛋白的生物特性。结果表明:PID1基因mRNA表达量在肝脏中最高,心脏中最低,其表达水平依次为肝脏>肾脏>肺脏>小肠>胃>脾脏>大肠>肌肉>心脏;白洗猪PID1基因的克隆CDS区与NCBI上传的序列一致;白洗猪PID1基因编码217个氨基酸,分子质量为24.8 ku,属亲水性蛋白,在PID1蛋白的二级结构中α螺旋比率较大,跨膜区预测分析未发现跨膜区域。

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