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1株J亚群禽白血病病毒env基因克隆及生物信息学分析

作  者：
陈玫婷;郑从森;梁泽贤;林巧儿;常传哲;周俊;冯军;李林林;覃丽梅
单  位：
广东省农业科学院动物卫生研究所;佛山科学技术学院生命科学与工程学院
关键词：
禽白血病病毒（ALV）;J亚群;env基因;生物信息学
摘  要：
【目的】通过生物信息学方法分析1株禽白血病病毒（Avian Leukosis virus, ALV）的囊膜蛋白env的分子特征。【方法】利用鸡成纤维细胞（DF-1）培养疑似禽白血病病鸡的血清样品，通过ELISA和实时荧光定量PCR鉴定ALV亚群。对env基因PCR产物进行测序，利用SeqMan拼接env基因。将该env基因与国内外多个ALV亚群进行序列比对及遗传进化分析，并借助多种生物信息学软件对env蛋白进行分析，包括理化性质、亲/疏水性、跨膜区、信号肽、糖基化位点、磷酸化位点、乙酰化位点、二级结构、三级结构、抗原决定簇和B细胞抗原表位预测。【结果】ALV-J毒株的env基因全长1 719 bp,获得GenBank登录号为OP837418,其与J亚群ALV位于同一进化分支，相似性为89.3%～94.8%。该env蛋白有2个跨膜区，是由572个氨基酸组成的不稳定的亲水蛋白，不稳定系数预测值为43.49,总平均亲水性为―0.201;该env蛋白为非分泌蛋白，无信号肽，有17个N-糖基化修饰位点、77个O-糖基化修饰位点、42个磷酸化修饰位点、21个潜在抗原决定簇和9个连续碱基数超过10个的B细胞线性表位。该env蛋白的二级结构中无规则卷曲占比最大，为38.29%。【结论】env基因是导致ALV遗传变异的关键基因，其编码的囊膜蛋白env具有不稳定性，存在多个蛋白修饰位点和抗原表位。

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