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Position: Home > Articles > 枇杷MIKCC型MADS-box全基因组鉴定及表达分析 Journal of Sichuan Agricultural University 2024,42 (6) 1203-1211

枇杷MIKCC型MADS-box全基因组鉴定及表达分析

作  者:
汪红霞;牛洁;唐孝富;杜莹;王苗;蒲靖;邓群仙;张慧芬
单  位:
四川农业大学园艺学院
关键词:
枇杷;MADS-box;基因家族;花发育
摘  要:
【目的】鉴定并分析枇杷中MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因在枇杷花芽发育中的表达模式。【方法】基于‘大五星’枇杷基因组数据库,利用生物信息学的方法鉴定出枇杷中的MADS-box基因,分析家族成员的保守基序,顺式作用元件和系统进化关系,并对其在‘春花1号’和‘果真好3号’2个品种花芽发育中的表达模式进行分析。【结果】在枇杷中共鉴定得到63个MIKCC型MADS-box基因,63个MIKCC型MADS-box基因被分为13个亚家族,不均匀地分布在14条染色体上。在基因家族成员上游启动子区域发现植物生长发育、胁迫反应、光响应和激素反应等相关的顺式作用元件。‘春花1号’和‘果真好3号’对应的MADS-box基因表现出相同的趋势且趋势主要分为表达量持续升高和持续降低,推测MADS-box基因在花芽发育过程中起重要作用。【结论】初步鉴定并分析了枇杷MIKCC型MADS-box基因成员,及其在花芽发育过程中的表达模式。结果为研究MADS-box基因参与枇杷花芽发育提供一定的参考。

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