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Position: Home > Articles > Evolutional analysis of two new isolates of Wheat yellow mosaic virus from Shandong Province,China Acta Phytopathologica Sinica 2017,47 (3) 348-356

小麦黄花叶病毒(WYMV)2个山东分离物的全基因组序列及进化分析

作  者:
耿国伟;于成明;王德亚;顾珂;师科荣;李向东;田延平;原雪峰
单  位:
山东农业大学动物科技学院;山东农业大学植物保护学院植物病理学系山东省农业微生物重点实验室
关键词:
小麦黄花叶病毒;系统发生树;RNA重组
摘  要:
利用5'RACE结合一步法RT-PCR分别从山东泰安与临沂冬小麦上克隆了小麦黄花叶病毒(Wheat yellow mosaic virus,WYMV)的全基因组序列。这2个分离物(TADWK和LYJN)基因组间核苷酸一致性分别为97.21%(RNA1)和95.12%(RNA2)。通过对目前已报道的共14个分离物的基因组不同部分的分析,表明5'UTR是WYMV基因组变化幅度最大的区域,而编码区(ORF)及3'UTR的序列一致性较高且变动幅度小。另外,发现LYJN RNA2的5'UTR与已报道的所有分离物RNA2的核苷酸一致率仅为90%左右。综合分析RNA1和RNA2的系统发生树,表明WYMV各基因组片段呈单独进化特征,不同分离物间存在RNA重排。RNA重组分析显示在LYJN RNA1和TADWK RNA2发现了RNA重组。此研究说明WYMV在山东地区存在分离物分化现象,WYMV的5'UTR是基因组中的突变热点。
译  名:
Evolutional analysis of two new isolates of Wheat yellow mosaic virus from Shandong Province,China

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