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Position: Home > Articles > A COMPARATIVE ANALYSIS ON THE GENETIC DIVERSITY OF TRICHIURUS LEPTURUS Acta Hydrobiologica Sinica 2019 (2) 282-290

基于线粒体COⅠ和16S rRNA基因序列比较分析东海带鱼群体遗传多样性

作者：

卞光明;王娜泠;胡则辉;王跃斌;胡成硕;柴学军

单位：

江苏省射阳县长荡镇农业技术推广服务中心;浙江省海洋水产研究所浙江海洋大学海洋与渔业研究所浙江省海水增养殖重点实验室

关键词：

东海带鱼;COⅠ;16S rRNA;遗传多样性

摘要：

测定了东海带鱼(Trichiurus lepturus Linnaeus)三个群体(命名为A:122°32′E 29°55′N、B:123°30′E26°75N;C:124°24′E 27°26′N)72个个体的线粒体DNA16S rRNA和COⅠ基因序列,通过单基因序列和联合序列分析,研究了东海带鱼群体的遗传变异情况。分别得到1130 bp的COⅠ基因序列片段和554 bp的16S rRNA序列片段,其中COⅠ基因片段的T、C、A、G含量分别为29.0%、28.9%、24.4%和17.7%;16S rRNA基因片段的T、C、A、G含量分别为22.7%、27.6%、28.0%和21.7%。基于线粒体16S rRNA、COⅠ和16S+COⅠ基因序列分析,72个个体中分别确定43个,8个和49个单倍型,存在单倍型共享现象。群体的单倍型多样性指数为0.9766—0.9992,显示了群体内的单倍型较为丰富。3个群体间各序列平均核苷酸差异数(K)在5.111—9.024和0.0045—0.0076,核苷酸多样性指数(π)为0.0048—0.0084,显示不同带鱼群体遗传多态性丰富。使用邻接法构建的分子进化树揭示同一群体内大部分个体聚在一起。分析结果表明,群体A遗传背景比群体B、群体C较为丰富,群体内部个体差异大于群体间差异,群体间基因交流频率较高,遗传分化不明显,初步判定东海带鱼3个群体的遗传多样性偏低。

译名：

A COMPARATIVE ANALYSIS ON THE GENETIC DIVERSITY OF TRICHIURUS LEPTURUS

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