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巴西橡胶树RALF基因家族的鉴定及其表达分析

作  者:
杨洪;王立丰;代龙军;赵溪竹
单  位:
中国热带农业科学院橡胶研究所农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室农业农村部儋州热带作物科学观测实验站省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室
关键词:
巴西橡胶树;RALF;快速碱化因子;基因家族;生物信息学;
摘  要:
快速碱化因子(rapid alkalinization factors, RALFs)是一种植物多肽类激素,参与胞内MAPK信号传递、细胞伸长调控、花器官发育及免疫应答等植物重要生理过程。本研究利用生物信息学方法对橡胶树RALF基因家族进行全基因组鉴定,对其序列特性、基因结构、保守基序、系统进化及表达特性进行系统研究。通过同源比对在橡胶树基因组中共鉴定到16个RALF基因,分别命名为HbRALF1~HbRALF16。序列分析结果表明,这些基因编码氨基酸数目介于108~149 aa之间,分子量和等电点分别介于11.92~16.88 kD和5.41~9.33。多序列比对结果表明,HbRALFs含有S1P蛋白酶识别位点、受体蛋白识别位点YISY保守序列和四个保守半胱氨酸。基于转录组数据的组织和乙烯刺激表达特性分析显示,16个橡胶树RALF基因至少在一个组织中表达,8个胶乳中高表达的RALF还参与乙烯刺激响应。本研究为进一步研究RALF基因家族在橡胶树关键农艺性状调控中的作用提供参考依据。

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