低盐胁迫下凡纳滨对虾鳃丝抑制性消减杂交cDNA文库构建及差异ESTs分析
广东海洋大学水产学院水产动物营养与饲料实验室
- 摘 要：
- 本研究以凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)为对象,分别以低盐度胁迫下(4 ppt)凡纳滨对虾鳃丝cDNA为检测子,正常海水中凡纳滨对虾鳃丝cDNA为驱动予,采用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建了急性低盐胁迫诱导下凡纳滨对虾鳃丝消减cDNA文库。文库的重组率均高于95%,插入片段集中在250~750 bp之间,随机测序后在线拼接得到15组片段重叠群和37个单一序列共52个非重复序列。同源检索发现30个非重复序列与GenBank中的已知基因序列有较高的相似性。按差异表达基因编码的蛋白具体功能可分为6小类,依次为:(1)离子通道及转运蛋白;(2)蛋白合成翻译及转录因子;(3)应激抗氧化因子;(4)能量代谢;(5)信号受体和转导;(6)细胞纤维及骨架蛋白,所占比例分别为23.3%、20.0%、20.0%、16.7%、10.0%和10.0%。经功能聚类分析发现文库中含有大量离子通道蛋白及功能转运酶、胞内信号传导分子、细胞骨架蛋白等渗透调节和应激适应性相关基因,表明急性低盐胁迫诱导凡纳滨鳃丝抑制性消减杂交cDNA文库构建成功。
关键词：凡纳滨对虾;鳃丝;低盐胁迫;抑制性消减杂交;表达序列标签
相似文章
-
凡纳滨对虾弧菌病及其防治方法研究进展 [李君怡, 吴秋平, 周疆, 王梅芳, 邹记兴, 范兰芬] 水产科技情报 2022,49 (2) 106-111
-
过硫酸氢钾干预下对虾养殖系统中水质指标和菌群结构变化分析 [蔡欣欣, 于永翔, 王印庚, 张正, 廖梅杰, 李彬, 刘潇, 朱洪洋, 荣小军] 上海海洋大学学报 2022 (2) 452-461
-
慢性氨氮胁迫对凡纳滨对虾生理生化指标及血蓝蛋白基因表达的影响 [顾楠, 戴习林] 南方农业学报 2021 (4) 1098-1107
-
生态冰温无水保活对凡纳滨对虾活力及肌肉品质的影响 [徐德峰, 吴嘉鑫, 郑晓娴, 孙力军, 秦小明, 范秀萍] 广东海洋大学学报 2022,42 (3) 87-96
-
生物絮团在凡纳滨对虾封闭养殖试验中的形成条件及作用效果 [邓应能, 赵培, 孙运忠, 杨丛海, 黄倢] 渔业科学进展 2012,33 (2) 71-77
-
不同放苗密度凡纳滨对虾生物絮团养殖的环境和产出效应 [张许光, 赵培, 王国成, 王秀华, 潘鲁青, 黄倢] 渔业科学进展 2013,34 (3) 111-119
-
基于微卫星标记评估凡纳滨对虾收获体长、体质量以及抗WSSV性状的遗传参数 [孙坤, 李旭鹏, 隋娟, 曹家旺, 谭建, 罗坤, 栾生, 孔杰, 孟宪红] 水产学报 2022,46 (4) 583-593
-
凡纳滨对虾血细胞图像流式检测与病原感染分析 [李荣, 任星潮, 张宁, 王媛, 刘逸尘, 张亦陈, 耿绪云, 孙金生] 水产学报 2022,46 (6) 1094-1103
-
基于环境DNA的进口凡纳滨对虾携带水传播虾肝肠胞虫风险评估 [张娜, 刘荭, 廖金湾, 郑晓聪, 郑枢, 刘骁, 谢艳辉, 李家侨, 李红权] 南方农业学报 2022,53 (1) 219-228
-
凡纳滨对虾丝氨酸蛋白酶同源物基因(Lv-SPH)的克隆及免疫应答特征 [尹丝雨, 何雨欣, 于娇, 张亦陈, 刘逸尘, 耿绪云, 孙金生] 水产学报 2022,46 (5) 815-824
