木薯谷胱甘肽过氧化物酶(MeGPX)基因全基因组鉴定及表达分析
海南恩红农业科技有限公司;海南大学
- 摘 要：
- 谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)作为一种抗氧化剂,在植物调节细胞活性氧(ROS)稳态和逆境胁迫响应方面起着重要作用,但至今未对木薯GPX基因家族开展系统研究.本研究利用生物信息学手段在木薯全基因组水平上对GPX基因家族成员进行鉴定,并分析其蛋白理化性质、进化关系、染色体定位、基因结构、启动子顺式作用元件及表达模式等.结果表明,木薯基因组中共有6条GPX基因,编码氨基酸数目在164~238之间,分别在6条染色体上不均匀分布;系统进化分析将木薯、拟南芥、水稻、玉米和毛果杨的GPXs分成7个类群,且类群之间具有相似的保守基序和外显子-内含子结构;启动子顺式作用元件分析发现MeGPXs包含多种激素响应、生长发育和胁迫响应相关的顺式作用元件;表达分析结果显示,MeGPX基因家族成员在植物不同组织之间和不同生物和非生物胁迫下表达,表明各成员在木薯抗逆响应过程中起到的作用不一致;RT-qPCR结果显示,MeGPX1,MeGPX5和MeGPX6的表达量在木薯细菌性枯萎病侵染后呈显著上调趋势(P<0.05).本研究结果将为深入研究木薯GPX基因家族功能提供理论支持.
关键词：木薯;谷胱甘肽过氧化物酶;基因家族;系统进化;基因表达模式
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