水稻'宜香优2115'OsIRT1基因的克隆及生物信息分析
凯里学院大健康学院;凯里学院数学科学学院
- 摘 要：
- 铁调节转运蛋白（iron-regulated transporter 1, IRT1）是植物从土壤中吸收铁的主要根系转运蛋白，参与植物铁和锌营养吸收过程，也是镉等有毒金属进入植物体内的主要途径。克隆富铁水稻（Oryza sativa L.）中IRT1基因，为研究该基因在植物铁转运过程中的功能提供参考。本研究采用同源克隆法，以富铁水稻品种‘宜香优2115’叶片总RNA为模板，通过RT-PCR获得水稻‘宜香优2115’IRT1基因，命名为OsIRT1-YXY2115，并对其进行生物信息学分析。生物信息分析表明，该基因cDNA编码区长为1 125 bp，编码374个氨基酸，蛋白序列含有9个跨膜结构，编码蛋白分子量为39.06 kD，理论等电点为8.89，溶液中的不稳定指数为45.73，为不稳定蛋白，该蛋白属于锌铁转运蛋白（ZRT/IRT-like protein, Zip）家族成员。序列同源性分析表明，其与已报道的水稻OsIRT1基因（AB070226.1）相似性最高。亚细胞定位预测分析表明，IRT1-YXY2115蛋白定位于细胞质膜中。IRT1-YXY2115基因克隆及其结构、性质与功能的初步分析为OsIRT1基因功能研究及水稻缺铁胁迫分子机理的解析提供参考和理论依据。
关键词：水稻（Oryza sativa L.）;铁;锌;OsIRT1基因;生物信息分析
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