文蛤CDK7基因克隆及其在不同品系生长发育中的表达分析
江苏省海洋水产研究所;上海海洋大学/水产科学国家级实验教学示范中心
- 摘 要：
- [目的]掌握文蛤(Meretrix meretrix)细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)基因(MmCDK7)的时空表达及在不同品系生长发育中的表达规律,从分子水平探究红壳色文蛤新品系的生长优势,为筛选文蛤生长相关基因及揭示其生长发育机制提供理论依据.[方法]利用RACE克隆MmCDK7基因cDNA序列,通过BLAST、ScanProsite、NetPhos 3.0 server及ExPASy等在线软件进行生物信息学分析,使用实时荧光定量PCR检测MmCDK7基因在文蛤不同组织和不同发育时期的表达情况,并比较同一养殖条件下红壳色文蛤(简称红文蛤)和黄壳色文蛤(简称黄文蛤)的壳长、壳长相对增长率及MmCDK7基因表达差异.[结果]MmCDK7基因cDNA序列全长1296 bp,其中,5'端非编码区(5'-UTR)为83 bp,3'端非编码区(3'-UTR)为196 bp,开放阅读框(ORF)为1017 bp,共编码338个氨基酸残基.MmCDK7蛋白分子量约38.32 kD,理论等电点(pI)为8.78,包含丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化结构域(S_TKc)、酪氨酸激酶催化结构域(TyrKc)及与细胞周期蛋白结合有关的激酶结构域NRTALRE;而S_TKc结构域中有包含蛋白激酶ATP结合位点区域、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活化位点区域及T-loop环.MmCDK7氨基酸序列与虾夷扇贝CDK7氨基酸序列高度同源,其相似性为75.00%;基于CDK7氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树显示,文蛤与中国真蛸、长牡蛎、厚壳贻贝及虾夷扇贝等软体动物先聚为一支.MmCDK7基因在性腺、水管、外套膜和肝胰腺等组织中均有表达,以性腺中的相对表达量显著高于其他组织(P<0.05,下同);MmCDK7基因在2种文蛤的8个发育时期均有表达,均以多细胞时期的相对表达量最高.在同一养殖条件下,除9月18日外,其他采样时间点均表现为红文蛤的壳长显著大于黄文蛤,红文蛤相对于黄文蛤的壳长增长率在2.79%~32.37%;除11月15日和11月30日外,其他采样时间点均表现为红文蛤的MmCDK7基因相对表达量显著高于黄文蛤的相对表达量.[结论]MmCDK7基因属于CDK家族成员,在细胞分裂旺盛的性腺及多细胞时期的相对表达量最高,且在生长速度较快红文蛤中的相对表达量多数情况下显著高于黄文蛤,故推测MmCDK7基因参与调控文蛤的早期生长发育过程.
关键词：文蛤;CDK7基因;基因克隆;时空表达;生长发育
相似文章
-
东营市水产品品牌建设研究 [陈聪聪, 杨玉艳, 于贞贞, 杨建新, 张云霞] 中国渔业质量与标准 2021 (5) 65-68
-
之五:缢蛏高产养殖模式 [孟伟] 中国水产 2005 (5) 60
-
红壳色文蛤选育群体的经济性状分析 [张雨, 陈爱华, 吴杨平, 许艳顺, 曹奕, 陈素华, 张志东] 水产养殖 2022,43 (5) 1-5
-
文蛤SRBI基因变异与红壳色性状的关联性 [施鹤鸣, 董迎辉, 姚韩韩, 包永波, 林志华] 水产学报 2021 (11) 1804-1813
-
文蛤动态能量收支模型构建、验证与应用 [张虎, 张俊波, 杨晨星, 贲成恺, 袁健美, 胡海生, 肖悦悦, 吕泽华, 万荣] 水产学报 2022,46 (6) 1036-1044
-
红壳色文蛤选育群体遗传多样性的微卫星分析 [田镇, 陈爱华, 曹奕, 吴杨平, 张雨, 陈素华, 张志东, 李秋洁] 南方农业学报 2021 (9) 2582-2589
-
文蛤与微藻协同作用对水体氮、磷消除效果研究 [张志东, 陈爱华, 吴杨平, 张雨, 曹奕, 陈素华, 田镇, 李秋洁] 水产科学 2022,41 (2) 243-249
-
Cu2+对文蛤红壳色选育系及自然群体抗氧化能力的影响 [田镇, 张志东, 陈爱华, 吴杨平, 陈素华, 张雨, 曹奕, 李秋洁] 水产科学 2022,41 (1) 62-68
-
青蛤与文蛤的营养成分分析与评价 [李晓英, 董志国, 阎斌伦, 程汉良, 孟学平, 沈和定, 李家乐] 食品科学 2010,31 (23) 366-370
-
文蛤CDK1基因在选育与自然群体早期生长阶段中的表达特征 [陈素华, 吴杨平, 陈爱华, 张雨, 曹奕, 田镇, 张志东, 李秋洁] 中国水产科学 2020 (9) 1042-1051
