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Position: Home > Articles > Cloning and bioinformatics analysis of NanA gene of Clostridium chauvoei Heilongjiang Animal Science and Veterinary Medicine 2020 (7) 96-100

气肿疽梭菌NanA基因克隆及生物信息学分析

作  者:
于成东;罗永仁;姜永越;马玉腾;张皓;陈竞;李成辉;方程;金鑫
单  位:
图们市农业农村局;珲春市边境经济合作区综合服务站;延边大学农学院
关键词:
气肿疽梭菌;NanA基因;基因扩增;克隆;理化性质分析;同源性比对
摘  要:
为了对气肿疽梭菌NanA基因进行克隆及生物信息学分析,试验根据GenBank中已发表的气肿疽梭菌NanA基因序列设计并合成1对特异性引物,以气肿疽梭菌总DNA为模板,扩增出NanA目的基因并克隆至pMD18-T载体中,对测序正确的NanA基因进行序列对比分析,对NanA蛋白进行理化性质分析与二级结构预测,同时使用在线软件预测NanA蛋白三级结构。结果表明:成功扩增出气肿疽梭菌Nan A基因,与参考序列相比,共存在3处核苷酸突变,核苷酸序列和氨基酸序列与NCBI公布的JF4135 NanA基因序列的同源性均为99.8%。NanA蛋白分子质量约为71 ku,具有较高的抗原指数,二级结构以β-折叠和无规则卷曲为主,有多个抗原表位区域。
译  名:
Cloning and bioinformatics analysis of NanA gene of Clostridium chauvoei
作  者:
YU Chengdong;LUO Yongren;JIANG Yongyue;MA Yuteng;ZHANG Hao;CHEN Jing;LI Chenghui;FANG Cheng;JIN Xin;

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