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白凤菜转录组学分析及类黄酮基因的剖析

作  者:
黄建军;谢伟容;郑晓艳
单  位:
漳州卫生职业学院药学院
关键词:
白凤菜;高通量测序;类黄酮;生物合成
摘  要:
白凤菜,是一味闽南地区及中国台湾著名的中草药,其作用多样,但近年来研究较少,特别是分子研究匮乏。本研究选择Illumina HiSeqTM平台对白凤菜的叶和茎进行了高通量测序,研究结果表明:一共拼接成93 975个高质量的unigene,其N50为1 146 bp,平均长度为624.78 bp;与基因本体数据库等七大数据库进行实验结果对比辨析,共有56 455个unigene至少顺利注释一个数据库,全部注释的有2 005个unigene。在白凤菜叶对根差异表达中共获得3 286个unigene,其中上升趋势表达1 852个,下降趋势表达1 434个。利用KEGG数据库,找到参与类黄酮生物合成的有39个unigene,具有显著差异的有11个,分布在12个合成酶中。此结果为进一步研究白凤菜黄酮类化合物生物合成和调控的分子机制提供理论基础。

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