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花蕾型和普通型灰毡毛忍冬花冠开裂过程的转录组比较分析

作  者:
刘思思;乔中全;刘新民;王晓明;曾慧杰;李永欣;蔡能
单  位:
湖南中医药大学中西医结合学院;湖南省林业科学院长沙市木本花卉工程中心
关键词:
灰毡毛忍冬;花蕾;花冠;转录组;
摘  要:
为探索花蕾型灰毡毛忍冬花冠不开裂、花蕾期长等特性背后的分子机制,本研究以花蕾型品种‘龙花’和普通型品种‘白云’为实验材料,利用RNA-Seq技术对灰毡毛忍冬花冠开裂过程3个不同时期的花进行转录组比较分析。结果显示,各样品的Clean reads介于18 685 062~28 236 097条之间,拼接共得到146 481个Unigenes,N50为1 415 bp,平均长度为952 bp,其中66 449个Unigenes得到功能注释,占Unigene总数的45.36%。相比于‘龙花’‘,白云’共有5 525个Unigenes在花冠开裂初期差异表达;9 559个Unigenes在中期差异表达,13 420个Unigenes在末期差异表达。对上述差异基因进行GO分析,分别有37个、58个、59个GO类别在‘白云’花冠开裂过程初期、中期和末期被显著富集。差异基因KEGG分析显示分别有7个、5个和1个代谢通路在‘白云’花冠开裂初期、中期和末期显著富集,主要涉及淀粉和蔗糖的代谢、植物激素信号转导、苯丙素生物合成、核糖体等代谢通路。此外,还在转录组数据中挖掘得到13个MADS-box基因在两个品种间的花冠开裂过程中有差异表达。本研究可为后续灰毡毛忍冬花冠开裂关键基因的挖掘、克隆与功能分析提供参考,为探明灰毡毛忍冬花冠开裂的分子机理以及灰毡毛忍冬优良新品种的分子遗传育种提供科学依据。

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