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猪戊型肝炎病毒甘肃分离株衣壳蛋白基因序列分析

作  者:
郝宝成;梁剑平;兰喜;刑小勇;项海涛;温峰琴;胡永浩;柳纪省
单  位:
甘肃农业大学动物医学院;中国农业科学院兰州兽医研究所;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所/农业部兽用药物创制重点实验室/甘肃省新兽药工程重点实验室
关键词:
猪戊型肝炎病毒;衣壳蛋白基因;序列分析
摘  要:
为进行国内猪戊型肝炎病毒(HEV)衣壳蛋白基因特征研究,参照GenBank中已发表的戊型肝炎病毒核苷酸序列,设计了1对扩增HEV衣壳蛋白(Y)基因的引物,利用RT-PCR等方法成功克隆出HEV甘肃分离株swCH189的Y基因cDNA片段,并与国内其他9株典型HEV分离株进行序列分析,用DNAstar软件进行序列同源性分析,PHYLIP软件绘制基因进化树。结果表明,swCH189株的Y基因与国内9株典型HEV分离株间的核苷酸序列同源性为79.6%~91.8%,推导的氨基酸序列同源性为91.4%~98.85%。基因进化树显示swCH189与基因Ⅳ型swCH25株亲缘关系最近,在同一分支上,属于基因Ⅳ型。

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