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Position: Home > Articles > Comparison of transcriptomic activity of Ilex integra and I. purpurea roots with NaCl treatments Journal of Nanjing Forestry University(Natural Sciences Edition) 2022,46 (3) 99-108

NaCl处理下全缘冬青和红果冬青根系的转录组活性比较

作者：

张强;周鹏;刘昌来;余永帆;张敏;杨甲定

单位：

南京林业大学;江苏省林业科学研究院

关键词：

全缘冬青;红果冬青;根系;NaCl盐胁迫;转录组分析;代谢途径

摘要：

[目的]研究全缘冬青(Ilex integra)和红果冬青(I.purpurea)的根系在NaCl胁迫处理中的转录组活性差异,为进一步研究二者耐盐性差异的生理学机理奠定基础.[方法]以内含250 mmol/L NaCl的1/2浓度霍格兰德溶液对全缘冬青和红果冬青的两年生扦插苗进行盐胁迫处理,采集经0(盐处理前)、6和72 h盐处理的根系样品,提取总RNA,进行转录组测序,组装转录本,筛选差异表达基因,分析两种冬青根系中的功能富集通路和特定代谢途径的基因表达变化.[结果]全缘冬青根系盐处理6 h的差异表达基因数量为2616,盐处理72 h为1802;而红果冬青根系盐处理6 h的差异表达基因数量为1831,盐处理72 h为3490.全缘冬青盐处理6和72 h根系中共同的KEGG富集途径为植物激素信号转导、亚油酸代谢、类胡萝卜素生物合成和甜菜红素生物合成,红果冬青根系6和72 h盐处理共同的KEGG富集途径为植物激素信号转导、苯丙烷生物合成和类胡萝卜素生物合成.甜菜红素生物合成和亚油酸/花生四烯酸代谢为盐胁迫处理全缘冬青根系中特有的富集代谢通路.全缘冬青中受盐胁迫正调控的过氧化氢酶基因数多于红果冬青的,并且在盐处理下其表达水平远高于红果冬青的.[结论]全缘冬青根系较强的耐盐性可能与植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成、甜菜红素生物合成和脂肪酸脂类代谢等生理过程相关联;盐处理下过氧化氢酶基因的高效表达也可能是全缘冬青根系具较强耐盐性的因素之一.

译名：

Comparison of transcriptomic activity of Ilex integra and I. purpurea roots with NaCl treatments

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