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一株重组犬冠状病毒的鉴定及3'端分子特征分析

作  者:
蔡冬冬;李建岗;范毅;罗毅;崔鹏博;胡晓亮;田志革
单  位:
四川省成都市动物疫病预防控制中心;四川省动物疫病预防控制中心;成都海关;宜宾学院农林与食品工程学部
关键词:
犬冠状病毒;S基因;重组;分子特征
摘  要:
为了解犬冠状病毒(CCoV)的基因组特征和遗传变异情况,本试验利用RT-PCR方法从患病犬肠道内容物中鉴定出一株CCoV,命名为BM35.通过RT-PCR方法扩增S、E、M、N和ORF7基因,然后对测序结果拼接并进行系统进化树和遗传重组分析.结果显示:BM35的3'端序列长度为8 870 bp;遗传进化树分析发现BM35与浙江株B639/ZJ/2019、台湾株NTU336、日本株FC 1和越南株HCM47处于同一独立分支;重组分析发现BM35与台湾株NTU156和越南株HCM47在S基因发生重组.本研究有助于深入了解国内CCoV流行毒株的分子特性,为后续CCoV诊断试剂和疫苗的开发提供依据.

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