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Position: Home > Articles > Strawberry Mottle Virus Isolated in Fujian:Complete Genome Sequence and Molecular Variation Chinese Agricultural Science Bulletin 2022,38 (6) 94-101

福建地区草莓斑驳病毒全基因组测序和分子变异分析

作  者:
陈道;王新;江山;张洁;吴祖建;丁新伦
单  位:
福建农林大学植物病毒研究所
关键词:
草莓斑驳病毒;高通量测序;全基因组序列;分子变异;遗传进化分析
摘  要:
为了深入解析草莓斑驳病-毒(strawberry mottle virus,SMoV)的分子变异以及遗传多样性,采用小RNA高通量测序结合RACE和RT-PCR技术获得了福建地区SMoV基因组全长序列.SMoV基因组RNA1和RNA2分别为7034 nt和6354 nt,均含有1个ORF,分别编码多聚蛋白P1和P2;SMoV福建分离物同其他15个SMoV分离物的同源性分析表明,RNA1核苷酸和多聚蛋白P1氨基酸同源性分别为79.2%~96.8%和89.0%~99.5%;RNA2核苷酸和多聚蛋白P2氨基酸同源性分别为77.9%~97.8%和89.9%~98.9%.SMoV福建分离物各编码蛋白同其他15个SMoV分离物的同源性分析表明,仅病毒基因组连接蛋白最为保守,其他各蛋白核苷酸序列和氨基酸序列变异均较大.福建分离物和中国部分分离物聚在一个大分支上,和中国分离物DGHY3亲缘关系最近.SMoV中国福建分离物的基因组结构与其他分离物相一致,其核苷酸序列和氨基酸序列分子变异较大,并且和中国其他分离物具有较丰富的遗传多样性,在进化上有一定的地理相关性.
译  名:
Strawberry Mottle Virus Isolated in Fujian:Complete Genome Sequence and Molecular Variation

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