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当前位置: 首页 > 文章 > 氧化还原酶辅因子的使用偏好与化学基础 山东农业大学学报(自然科学版) 2009,40 (3) 393-397
Position: Home > Articles > THE USAGE BIAS OF REDOX COFACTORS AND CHEMICAL BASIS Journal of Shandong Agricultural University(Natural Science Edition) 2009,40 (3) 393-397

氧化还原酶辅因子的使用偏好与化学基础

作  者：
陈蕾;曲戈
单  位：
山东师范大学生命科学学院;山东理工大学山东省生物信息工程技术研究中心
关键词：
氧化还原;辅因子;生物信息学;化学信息学
摘  要：
为了探究氧化还原酶对不同辅因子的使用偏好性,使用生物信息学方法对40个物种体内氧化还原酶辅因子的使用频率进行了统计分析,发现古核生物和原核生物体内大约90%的氧化还原酶使用有机辅因子,真核生物体内约78%的氧化还原酶选择使用有机辅因子。为了进一步解释上述现象,一方面,对氧化还原反应方程式进行了分析,发现有机酶组约28.5%的反应需要氧气的参与;而金属酶组约63.2%的反应需要氧气的参与,由此我们推断氧气的出现有可能是导致金属辅因子使用频率升高的重要原因;另一方面,使用化学信息学方法对氧化还原反应涉及的小分子进行了化学性质的分析,发现有机酶组小分子的分子量和亲水性都比较高,由此我们推断金属辅因子更适于疏水的反应环境。
译  名：
THE USAGE BIAS OF REDOX COFACTORS AND CHEMICAL BASIS
作  者：
CHEN Lei1,2,QU Ge2(1.College of Life Sciences,Shandong Normal University,Jinan 250014,China;2.Shandong Provincial Research Center for Bioinformatic Engineering and Technique,Center for Advanced Study,Shandong University of Technology,Zibo 255049,China)
关键词：
Redox reaction;cofactors;bioinformatics;chemoinformatics
摘  要：
In order to explore the usage bias of redox cofactors,we analysed the cofactor usage in forty species by bioinformatics method and found the distribution rule: about 90% redox enzymes used organic cofactors in archaeon and prokaryotes and about 78% redox enzymes used organic cofacotrs in eukaryotes.In order to explain above rule,we had done the following researches.First,we analysed the redox reaction equations.The results indicated that 28.5% organic enzymes reactions need oxygen and 63.2% metallic enzymes reactions need oxygen.Therefore,we inferred that the emergence of oxygen was one of the most important reasons probably that induced the increase of usage frequence for metallic cofactors.Secondly,we analysed the chemical characters of small molecules participating in the redox reactions.The results indicated that the small molecules of organic reactions group were much bigger and hydrophilic.Therefore,we inferred that metallic cofactors were suitable for hydrophobic environment.

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