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基于GBS测序的3个野生单环刺螠群体遗传多样性和群体结构分析

作  者:
尤宏争;孟睦涵;马林;郑艳坤;王永辉;孙阳;毕相东;孙学亮
单  位:
天津农学院水产学院;唐山瑞辉水产养殖有限公司;大连市海洋发展事务服务中心;天津市农业发展服务中心;天津市水产研究所
关键词:
单环刺螠;GBS测序;野生群体;遗传多样性;群体结构
摘  要:
【目的】旨在评估我国野生单环刺螠群体的遗传多样性和群体结构。【方法】采集大连、唐山、烟台3个群体样本,利用GBS测序技术获取SNP标记位点信息,分别对其期望杂合度、观测杂合度、核苷酸多样性、分子方差、聚类及群体结构等进行分析。【结果】3个野生单环刺螠群体观测杂合度为0.212~0.223,期望杂合度为0.239~0.257;核苷酸多样性在0.252~0.271之间。遗传变异主要来源于单环刺螠群体内部。3个自然群体可分成2个遗传群体,样本未根据地理位置表现出明显的群体结构。【结论】我国野生单环刺螠具有中等遗传多样性。

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