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番鸭呼肠孤病毒YB株σC蛋白同源性分析及B细胞表位预测

作  者:
吴晓平;张红星;吴异健;韩典霖;吴宝成;黄一帆
单  位:
福建农林大学动物科学学院
关键词:
番鸭呼肠孤病毒;σC蛋白;同源性;B细胞表传
摘  要:
为预测番鸭呼肠孤病毒(DRV)YB株σC蛋白二级结构和B细胞抗原表位,对DRVYB株的σC蛋白氨基酸序列与参考DRV相应序列以DNAStar软件进行同源性和遗传进化树分析;采用SOPMA法、Gamier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schultz法方法预测其二级结构;用Hopp-Woods法、Emini法、Iameson-wolf法和吴玉章等建立的方法分别预测蛋白的亲水性、表面可能性和抗原指数,然后综合分析其B细胞抗原表位.结果显示,DRVYB与国内DRV相应序列同源性在93.7%-99.6%,代表性较强;B细胞表位可能在15-27、36-49、40-49及90-98区段或其附近,这4个被预测的表位均含有β-转角和无规卷曲结构.本研究为进一步确定σC蛋白的B细胞表位和反向疫苗设计提供了理论基础.
译  名:
Homology Analysis and B Cell Epitopes Prediction for Protein σC of YB Strain of Muscovy Duck Reovirus

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