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梅花鹿接种卡介苗对信号通路影响的RNA-seq分析

作  者:
姜棋文;杨雪瑶;葛楠;孙江洋;葛桂阳;尹纪营;苏凤艳
单  位:
吉林省梅花鹿高校养殖和产品开发技术工程中心;吉林农业大学中药材学院  ;吉林农业大学中药材学院
关键词:
卡介苗;梅花鹿;转录组测序;GO功能注释;KEGG富集;
摘  要:
为了研究梅花鹿接种卡介苗前后信号通路的变化情况,取接种卡介苗(DF组)和未接种卡介苗(SY组)的梅花鹿外周血进行转录组测序,构建mRNA文库,利用DESeq软件对获得的mRNA进行差异表达分析,根据分析结果,选取免疫相关表达上调基因进行qPCR验证。结果表明:DF组和SY组共有1 337个显著差异表达的基因,其中上调基因658个,下调基因679个;差异基因主要参与机体应激、信号转导、调节白细胞迁移等生物学过程。梅花鹿接种卡介苗后主要富集到PI3K-Akt、Notch、NF-κB、Toll样受体以及细胞外基质受体相互作用等免疫相关的信号通路。qPCR检测结果与高通量测序结果一致。说明接种卡介苗后,梅花鹿体内的蛋白质及细胞外基质修饰过程得到了增强,受体活性肽、转录因子的结合能力和细胞因子活性增强。

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