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苹果属PP2C A亚家族基因的克隆及生信分析

作  者:
许璇;何钰贤;姚允聪;卢艳芬
单  位:
北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京重点实验室
关键词:
蛋白磷酸酶;脱落酸;基因;克隆;生物信息学;苹果属;
摘  要:
【目的】为探明苹果属植物响应脱落酸信号的分子机制。【方法】根据拟南芥PP2C A亚家族基因编码区序列进行同源性分析,利用RT-PCR技术,从‘平邑甜茶’cDNA中得到并克隆了3种MhPP2C基因,随后利用生物信息学手段分析其序列特征。【结果】分离得到的3种PP2C A亚家族基因MhABI1、MhABI2和MhHAB分别编码552,552和544个氨基酸的亲水性蛋白,其预测表观相对分子量分别为59.38、59.44、58.26 kDa,理论等电点为4.52~5.03;其中1个稳定蛋白和2个不稳定蛋白。这3个蛋白均含有PP2C超家族保守功能结构域,无跨膜结构及信号肽序列,主要定位于细胞核。【结论】这3种苹果属PP2C A亚家族基因可能在苹果砧木‘平邑甜茶’ABA信号网络中发挥重要作用。

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