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黔画乌鸡条码研究

作  者:
游敏芳;杜丹;廖朝美;蒋会梅;张义玲;杨远清;向成举;杨红;张依裕
单  位:
贵州省毕节市畜禽遗传资源管理站;贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室
关键词:
黔画乌鸡;DNA条码;COI基因;遗传多样性
摘  要:
DNA条码可以计算物种的遗传多样性并鉴定物种的身份。为了对黔画乌鸡进行品种鉴定,筛选出较纯的品种对其进行保种选育,笔者采用DNA直接测序法和人工校对来检测DNA条形码区COI基因的单核苷酸多态位点,构建系统进化树并分析其遗传多态性。结果共筛查得到5个突变位点:g.14852 T>C,T和C的等位基因频率分别为0.825和0.175,多态信息表达量(PIC)为0.247;g.14894T>C,T和C的等位基因频率为0.850和0.150,PIC为0.223;g.14993 A>G,A和G的等位基因频率为0.825和0.175,PIC为0.247;g.15110 G>A,A和G的等位基因频率为0.025和0.975,PIC为0.048;g.15121 G>A,A和G的等位基因频率为0.025和0.975,PIC为0.048。5个多态位点均为低度多态。共筛查得到4种单倍型,分别是TTAGG、CCGGG、TTGGA和CCGAG,这4种单倍型的遗传距离为0.002~0.008,平均遗传距离为0.005。4种单倍型之间不存在交叉现象,且与雪峰乌骨鸡、丝羽乌骨鸡、余干乌骨鸡、藏鸡、北京油鸡、高脚鸡、河田鸡、鹿苑鸡、狼山鸡、茶花鸡、大骨鸡无交叉现象,单独成支。

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