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Position: Home > Articles > Screen and annotation of differentially expressed genes in longissimus dorsi muscle of Huai pig and Duroc pig Journal of Fujian Agriculture and Forestry University(Natural Science Edition) 2016,45 (2) 192-195

槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释

作  者:
杨建敏;胡宇平;林威敏;张金耀;黄守婷;叶鼎承;肖天放
单  位:
福建农林大学动物科学学院;福建省农业科学院畜牧兽医研究所
关键词:
槐猪;杜洛克猪;背最长肌;差异表达;转录组测序
摘  要:
为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路.
译  名:
Screen and annotation of differentially expressed genes in longissimus dorsi muscle of Huai pig and Duroc pig

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