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编码酿酒酵母丙酮酸脱羧酶(Pdc6)基因克隆及其生物信息学分析

作  者:
王长丽;廖巍;叶广彬;葛菁萍;刘磊;马毓坚;黄霞;宾晓芸
单  位:
黑龙江大学生命科学学院微生物省高校重点实验室;右江民族医学院
关键词:
酿酒酵母;生物信息学分析;克隆;丙酮酸脱羧酶基因;开放阅读框;
摘  要:
旨在从生物信息学角度更好地研究酿酒酵母丙酮酸脱羧酶(Pdc6)的结构和功能,克隆酿酒酵母H5的丙酮酸脱羧酶基因pdc6。利用Primer 5.0软件设计1对20 bp引物,以H5基因组DNA为模板克隆获得pdc6,并利用生物信息学分析方法对其序列进行验证及分析。该序列长度为1692 bp,无碱基缺失,且该基因具有完整的开放阅读框,该基因编码的Pdc6包含563个氨基酸残基,该蛋白质中酸性氨基酸残基数量和碱性氨基酸残基数量大致相同;Pdc6理论等电点5.8,疏水性最大值为2.32,亚细胞定位预测其位于细胞外基质,属于酸性蛋白质,并预测了空间结构模型。本研究说明该蛋白结构与Pdc1和Pdc5结构类似,对酿酒酵母H5编码丙酮酸脱羧酶(Pdc6)基因序列克隆和生物信息学分析后,可为后续单基因敲除选取基因顺序的研究提供一定的理论基础。

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