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野猪白细胞抗原DQB外显子2核苷酸多态性研究

作  者:
董高华;徐怀亮;姚永芳;黄晓峰
单  位:
重庆市开县畜牧兽医局;四川农业大学动物科技学院
关键词:
SLA-DQB;遗传多样性;野猪;外显子2
摘  要:
采用DNA测序技术测定了15头野猪235 bp的SLA-DQB基因外显子2序列,结合GenBank中报道的另外3头野猪和18头家猪共36头个体的相应序列,重点进行野猪SLA-DQB外显子2的核苷酸多态性分析.结果:18头野猪中检出26个变异位点,其中2个为单变异位点,24个为简约信息位点.同时发现7个野猪群体所特有多态位点,占野猪突变位点总数的26.92%;野猪235 bp的SLA-DQB基因外显子2序列的非同义突变率较高,占总突变位点总数的84.62%;野猪的单倍型多样度为(0.971±0.027),核苷酸多样度为(0.034 69±0.005 89).用Kimura双参数法计算野猪种群内个体的平均遗传距离为0.037,野猪种群和家猪种群间的平均遗传距离为0.053.这些结果表明野猪SLA-DQB外显子2具有较丰富的核苷酸多态性;在家猪品种改良中,野猪具有潜在的遗传价值.

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