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4种重要外来病毒高通量液相芯片检测方法的建立

作  者:
仇汝龙;阮智杨;胡波;魏后军;范志宇;宋艳华;陈萌萌;徐为中;王芳
单  位:
江苏省农业科学院兽医研究所/农业部兽用生物制品工程重点实验室
关键词:
检测方法;液相芯片;基因序列;条件优化;流行病学;
摘  要:
为建立小反刍兽疫病毒(PPRV)、西尼罗病毒(WNV)、裂谷热病毒(RVFV)和南非型口蹄疫病毒(SAT FMDV)的高通量液相芯片检测方法,根据GenBank上公布的PPRV的N蛋白基因序列、WNV的E蛋白基因序列、RVFV的S片段基因序列和FMDV的5′UTR区基因序列,并基于各基因保守区设计相应的引物和探针。通过对多重PCR的上游、下游引物比例、杂交温度、杂交时间进行条件优化,并验证检测方法的特异性和敏感性。敏感性试验显示,该方法对于PPRV、WNV、RVFV以及FMDV4种病毒最低检出量分别为5.78×103、2.15×103、2.98×105、9.54×104 copies/μL。本研究建立的高通量液相芯片检测方法能够同时快速地检测4种外来病病毒,具有良好的特异性、敏感性和稳定性,对于流行病学调查和防范外来动物疫病具有重要的意义。

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